8月16日，由深圳國(guó)家基因庫(kù)主辦，深圳華大生命科學(xué)研究院、深圳市華大基因?qū)W院、深圳市猛犸公益基金會(huì)協(xié)辦，DataCastle承辦的"數(shù)源杯"百萬(wàn)單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)算法大賽決賽在深圳國(guó)家基因庫(kù)順利舉行。

經(jīng)過(guò)初賽、復(fù)賽的嚴(yán)格評(píng)審篩選，10支隊(duì)伍從300余個(gè)參賽團(tuán)隊(duì)中脫穎而出進(jìn)入本次的最后決戰(zhàn)。經(jīng)過(guò)激烈角逐決出最終結(jié)果：來(lái)自華中科技大學(xué)的柳嘉鑫同學(xué)一舉奪魁，另外9支來(lái)自浙江大學(xué)、波士頓大學(xué)、西安交通大學(xué)等高?；驒C(jī)構(gòu)的隊(duì)伍分別榮獲二、三等獎(jiǎng)和優(yōu)秀獎(jiǎng)。

"數(shù)源杯"百萬(wàn)單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)算法大賽于5月17日正式開(kāi)啟，鼓勵(lì)相關(guān)領(lǐng)域的研究人員和從業(yè)者以國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)存儲(chǔ)的百萬(wàn)單細(xì)胞數(shù)據(jù)資源為基礎(chǔ)，針對(duì)“聚類(lèi)”這一單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的重要步驟，進(jìn)行單細(xì)胞聚類(lèi)算法的開(kāi)發(fā)和優(yōu)化，進(jìn)而打造能夠降低內(nèi)存占用、提升運(yùn)算速度的優(yōu)質(zhì)計(jì)算工具;與此同時(shí)，為生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等多領(lǐng)域的專(zhuān)業(yè)人才提供跨領(lǐng)域、跨學(xué)科的技術(shù)交流平臺(tái)。本次大賽吸引了國(guó)內(nèi)外100余家知名高校和近90家企事業(yè)單位的專(zhuān)業(yè)技術(shù)人員參與，包括北京大學(xué)、清華大學(xué)、波士頓大學(xué)、費(fèi)城兒童醫(yī)院、中科院計(jì)算所、解放軍總醫(yī)院、華為、騰訊、百度、平安科技等。累計(jì)提交作品1819個(gè)。

重磅開(kāi)場(chǎng)

下午兩點(diǎn)，決賽正式開(kāi)始，華大集團(tuán)聯(lián)合創(chuàng)始人、董事、理事長(zhǎng)楊煥明院士和深圳國(guó)家基因庫(kù)主任王韌博士分別發(fā)表寄語(yǔ)和致開(kāi)幕辭。楊煥明院士在寄語(yǔ)中指出生命的基本結(jié)構(gòu)/功能單位是細(xì)胞，今天我們做單細(xì)胞研究就是把細(xì)胞水平和基因?qū)用娴难芯拷Y(jié)合起來(lái)。同時(shí)他還對(duì)選手們提出期望：“在這次的競(jìng)賽中你們每一個(gè)人都是勝利者，我更希望在你們中涌現(xiàn)出一些高手，改變我們對(duì)生命的認(rèn)識(shí)，改變現(xiàn)有生命解碼工具!”

王韌博士在致辭中首先代表深圳國(guó)家基因庫(kù)向?yàn)楸敬未筚愄峁┲С值乃袉挝?、社?huì)團(tuán)體及個(gè)人表示衷心的感謝。他表示入圍決賽的10支隊(duì)伍是充滿創(chuàng)造力和活力的，他們勇于瞄準(zhǔn)科技前沿，迎難而上，搶占先機(jī)，用自己的智慧為我國(guó)單細(xì)胞研究工作貢獻(xiàn)力量。接下來(lái)他還指出生物學(xué)大廈不是一個(gè)人建立的，只有各位年輕的生物工作者通力合作，才能實(shí)現(xiàn)學(xué)術(shù)上的重要突破。“今天不只是一個(gè)比拼的戰(zhàn)場(chǎng)，更是一個(gè)交流的平臺(tái)，希望各位能在今天的比賽中激發(fā)新的靈感，擦出不一樣的火花!”

精彩答辯

浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭國(guó)驥教授、清華大學(xué)古槿副教授、哈工大(深圳)-奇安信數(shù)據(jù)安全研究院韓培義副院長(zhǎng)、深圳華大生命科學(xué)研究院劉石平博士和國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)負(fù)責(zé)人魏曉鋒坐鎮(zhèn)擔(dān)任決賽評(píng)委，進(jìn)入決賽的10支隊(duì)伍分別對(duì)各自的算法模型展開(kāi)精彩論述。值得一提的是，現(xiàn)有百萬(wàn)單細(xì)胞聚類(lèi)算法的平均運(yùn)算時(shí)長(zhǎng)為6~8小時(shí)，復(fù)賽階段排名第一的隊(duì)伍已經(jīng)將此時(shí)長(zhǎng)縮短到0.3小時(shí)，大大提升了計(jì)算效率。

每支參賽隊(duì)伍論述結(jié)束后，評(píng)委專(zhuān)家進(jìn)行提問(wèn)，隨后從算法模型創(chuàng)新性、架構(gòu)設(shè)計(jì)、復(fù)雜度以及答辯過(guò)程的PPT陳述、邏輯性等方面進(jìn)行評(píng)分。本次大賽的最終評(píng)分由線上得分和答辯得分兩部分組成，按二者加權(quán)后的最終得分進(jìn)行排名。

上圖：答辯現(xiàn)場(chǎng)

10支參賽隊(duì)伍答辯完成后，韓培義副院長(zhǎng)作為專(zhuān)家代表、深圳華大生命科學(xué)研究院徐訊院長(zhǎng)作為大賽首席科學(xué)家分別為本次大賽進(jìn)行了總結(jié)和展望。韓培義副院長(zhǎng)指出計(jì)算機(jī)技術(shù)正在與其他學(xué)科交叉，尤其是生物學(xué)。他鼓勵(lì)大家善用公共數(shù)據(jù)庫(kù)(例如國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái))的數(shù)據(jù)和算力資源將想法付諸實(shí)踐。徐訊院長(zhǎng)表示BT與IT融合(生物與信息融合)是“十四五”國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃，本次競(jìng)賽就是利用IT解決BT問(wèn)題的實(shí)際應(yīng)用。他還指出接下來(lái)數(shù)源杯還計(jì)劃圍繞時(shí)空組技術(shù)數(shù)據(jù)解析問(wèn)題發(fā)起競(jìng)賽，期待有越來(lái)越多不同學(xué)科背景的人才參與進(jìn)來(lái)，共同推進(jìn)BT與IT融合創(chuàng)新。

冠軍出爐

經(jīng)過(guò)激烈的角逐，本次大賽的結(jié)果正式揭曉：

上圖：參賽選手與評(píng)委專(zhuān)家云合影。本次決賽根據(jù)國(guó)家疫情防控要求，嚴(yán)格控制參會(huì)人數(shù)，以“線上+線下”相結(jié)合的形式進(jìn)行。

至此"數(shù)源杯"百萬(wàn)單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)算法大賽圓滿落幕。參賽選手們紛紛表示這既是一場(chǎng)有意義的競(jìng)賽，也是一次非常有趣的跨學(xué)科交流會(huì)，讓計(jì)算機(jī)、數(shù)學(xué)、生物學(xué)等多學(xué)科背景的專(zhuān)業(yè)人才在此碰撞出新的數(shù)據(jù)分析思路。

未來(lái)，國(guó)家基因庫(kù)將基于國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)的數(shù)據(jù)和算力資源，以解決多組學(xué)數(shù)據(jù)分析難點(diǎn)問(wèn)題為目標(biāo)，持續(xù)舉辦數(shù)源杯系列大賽。通過(guò)跨領(lǐng)域人才的交流協(xié)作，促進(jìn)生物學(xué)與其他學(xué)科的交叉融合，推動(dòng)更多組學(xué)數(shù)據(jù)計(jì)算工具的開(kāi)發(fā)及應(yīng)用，為科學(xué)研究及產(chǎn)業(yè)發(fā)展帶來(lái)新視角。

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